A frequência do curso de Doutoramento em Estudos Portugueses poderá ser efetuada a tempo integral (3 anos) ou a tempo parcial (5 anos). No ato da candidatura, o estudante seleciona o regime pretendido, embora possa vir a alterá-lo posteriormente.

No regime de tempo integral, ao longo dos dois semestres que compõem o 1.º ano do curso, o estudante deverá inscrever-se em duas unidades curriculares obrigatórias (1.º semestre) e em duas unidades curriculares opcionais (2.º semestre). Estas últimas poderão ser escolhidas entre as que pertencem à especialidade em que está inscrito ou entre as que pertencem a qualquer das outras três especialidades do curso. A conclusão com sucesso da parte curricular do curso (no final do 1.º ano) faculta a obtenção de um Diploma de Estudos Avançados.

No 1.º semestre do 2.º ano do curso, o estudante inscreve-se no Seminário de Orientação I e elabora um Projeto de tese, sob a supervisão do docente que escolheu como orientador. Tendo concluído com aproveitamento o Seminário de Orientação I, o estudante inscreve-se no Seminário de Orientação II, prosseguindo, no 2.º semestre do 2.º ano, a investigação prevista no Projeto.

Os Seminários de Orientação I e II concretizam-se em sessões de orientação científica, de debate sobre o trabalho e de aferição do respetivo progresso. A planificação dos trabalhos (síncronos e/ou assíncronos) é da responsabilidade do orientador e do doutorando.

Por fim, no 3.º ano e último ano do curso, o estudante inscreve-se no seminário anual Redação da tese. Deverá prosseguir com a investigação, visando concluir a tese de doutoramento. A apresentação e discussão da tese de doutoramento são realizadas em sessão de natureza pública, especialmente convocada para o efeito. Aos estudantes aprovados no ato de defesa pública da tese de doutoramento é atribuído o grau de Doutor em Estudos Portugueses, titulado por uma carta doutoral e pelo respetivo certificado.